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日前，深圳爱尔眼科医院、深圳市爱尔眼科技术研究所秦波教授团队在中科院一区Top期刊《Ageing Research Reviews》（老年医学领域最具权威的国际学术期刊之一，影响因子13.100）发表了题为 “Single-cell RNA sequencing in dissecting microenvironment of age-related macular degeneration: Challenges and perspectives”的论文，总结了单细胞RNA测序技术在研究年龄相关性黄斑变性微环境中的应用及进展。
论文导读：
年龄相关性黄斑变性（Age-related Macular Degeneration，AMD）是导致50岁以上人群失明的主要原因之一，目前其病因和发病机制仍未清楚。单细胞RNA测序（Single-cell RNA sequencing，scRNA-seq）是最近发展起来的新技术，可在单个细胞水平进行高通量转录组测序，与传统的RNA测序技术相比，它能揭示复杂微环境中不同细胞类型的异质性、细胞亚型的演化以及细胞间通信的互作网络，是疾病诊断、机制研究及药物开发的有力工具。
本综述总结了在AMD发展过程中scRNA-seq发现的新的细胞亚群和分子调控机制。此外，本文还讨论了通过单细胞测序技术探索AMD的病理生理学时所面临的主要挑战和困难，并展望了基于单细胞技术的多组学及相关技术的发展趋势，为AMD的基础及临床研究的提供了新的策略和研究方向。
目前，单细胞测序已经成为一项广泛应用于生物医学各个领域的重要技术。在眼科学研究中，人类视网膜、脉络膜及动物模型等视觉系统中都应用了单细胞测序技术，发掘出新的基因表达图谱并确定了新的视网膜细胞类型，在揭示视网膜相关疾病发病机制中发挥重要作用。尽管在单细胞测序数据的分析、整合和解释方面取得了显著进展，但仍然存在一定的挑战。比如，由于AMD发病过程中视网膜微环境部分细胞处于异常或损伤状态，对实验条件的刺激十分敏感。因此，如何优化实验步骤，在尽量不改变组织细胞表达谱的情况下将组织消化成单个细胞，是获得优质单细胞数据的最重要一步。另外，如何获得疾病发生过程中细胞的时间和空间的信息，解答AMD发生过程中的细胞变化和互相作用，仍是研究的重点和难点。
对于单细胞测序技术的展望，秦波团队指出，研究人员正努力将世界各地研究团队的单细胞测序数据进行整合分析，挖掘疾病相关的新细胞亚群，寻找新的药物靶点。同时开发集基因组学、转录组学、表观遗传组学、蛋白组学及代谢组学等多组学为一体的单细胞时空多组学技术，为全面了解疾病的发展机制提供新的解决方案。总之，单细胞测序技术的快速发展在AMD研究领域中带来了革命性的变化，也将为AMD患者实现疾病的精准诊断、精准治疗带来福音。
图1.单细胞技术在探索AMD发病机制中的挑战
图2. 未来利用单细胞测序技术挖掘AMD发病机制的研究方向和趋势
秦波
爱尔眼科医院集团深圳特区总院长
爱尔眼科医院集团深圳特区总院长
主任医师、教授、博士研究生导师、博士后合作导师、美国斯坦福大学医学院访问学者 博士后
擅长：眼底病、眼外伤、复杂性白内障、ICL手术
成就：
爱尔眼科医院集团深圳特区总院长，暨南大学附属深圳爱尔眼科医院院长，集团眼底病学组副组长,深圳市爱尔眼科技术研究所所长。
亚太眼外伤学会委员、中华医学会眼科学分会眼外伤学组委员、中国医师协会眼科医师分会眼外伤学组委员、中国医师协会中西医结合医师分会眼科专业委员会委员、广东省中西医结合学会眼科专业委员会副主任委员、深圳市医学会眼科专业委员会副主任委员、深圳市医师协会眼科医师分会副会长、深圳市视光学会副会长、深圳市视光学会眼底病眼外伤专委会主委、深圳市眼外伤重点学科首席专家。
暨南大学、天津大学、安徽医科大学硕博导，中南大学爱尔眼科学院、贵州医科大学、汕头大学硕导。
从事眼底病、眼外伤及眼科疾病的临床诊疗工作近三十年，临床经验丰富。目前在研各级科研课题10余项，以第一或通讯作者发表论文80余篇，其中SCI论文15篇，主编、参编专业书籍11部。曾担任深圳市眼科医院业务副院长、湘雅二院深圳医院党委书记。获评深圳市高层次专业人才、深圳市医院十佳管理者、深圳市“五一劳动奖章获得者”、“深圳好医生”等。
刘东成
深圳爱尔眼科医院 专职科研人员
深圳市爱尔眼科技术研究所项目负责人
中山大学-美国宾夕法尼亚大学联合培养博士，深圳市海外高层次人才，深圳市医师协会精准医学医师分会委员，中国研究型医院学会病毒肿瘤学专业委员会委员。主要从事非编码RNA、RNA甲基化及相关蛋白在眼部疾病中的调控作用及分子机制研究。
主持国家自然科学基金青年项目1项、湖南省自然科学基金1项、深圳市自然科学基金面上项目2项，参与国家自然科学基金面上项目3项、广东省基础与应用基础研究基金面上项目及重点项目各1项，深圳市自然科学基金重点项目2项。已在Nature communication, Molecular Cancer, Signal Transduction and Targeted Therapy，Journal of Virology等杂志发表SCI论文10篇。
论文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37549871/